Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RALAP11233 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RALAP11233 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RALAP11233 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RALAP11233 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RALAP11233 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RALAP11233 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RALAP11233 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RALAP11233 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RALAP11233 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RALAP11233 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RALAP11233 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RALAP11233 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RALAP11233 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RALAP11233 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RALAP11233 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RALAP11233 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RALAP11233 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RALAP11233 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RALAP11233 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RALAP11233 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RALAP11233 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RALAP11233 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RALAP11233 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RALAP11233 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RALAP11233 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RALAP11233 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RALAP11233 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RALAP11233 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RALAP11233 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RALAP11233 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RALAP11233 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RALAP11233 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RALAP11233 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RALAP11233 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RALAP11233 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RALAP11233 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RALAP11233 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RALAP11233 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RALAP11233 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RALAP11233 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RALAP11233 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RALAP11233 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RALAP11233 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RALAP11233 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RALAP11233 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RALAP11233 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RALAP11233 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RALAP11233 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RALAP11233 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RALAP11233 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RALAP11233 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RALAP11233 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RALAP11233 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RALAP11233 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RALAP11233 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RALAP11233 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RALAP11233 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RALAP11233 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RALAP11233 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RALAP11233 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RALAP11233 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RALAP11233 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RALAP11233 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RALAP11233 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RALAP11233 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RALAP11233 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RALAP11233 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RALAP11233 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RALAP11233 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RALAP11233 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RALAP11233 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RALAP11233 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RALAP11233 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RALAP11233 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RALAP11233 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RALAP11233 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RALAP11233 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RALAP11233 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RALAP11233 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RALAP11233 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RALAP11233 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RALAP11233 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RALAP11233 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RALAP11233 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RALAP11233 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RALAP11233 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RALAP11233 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RALAP11233 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RALAP11233 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RALAP11233 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RALAP11233 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RALAP11233 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RALAP11233 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RALAP11233 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RALAP11233 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RALAP11233 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RALAP11233 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RALAP11233 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RALAP11233 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms