Protein–RNA interactions for Protein: O75449

KATNA1, Katanin p60 ATPase-containing subunit A1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNA1O75449 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KATNA1O75449 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KATNA1O75449 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KATNA1O75449 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KATNA1O75449 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KATNA1O75449 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KATNA1O75449 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KATNA1O75449 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KATNA1O75449 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KATNA1O75449 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KATNA1O75449 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KATNA1O75449 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KATNA1O75449 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KATNA1O75449 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KATNA1O75449 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KATNA1O75449 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KATNA1O75449 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KATNA1O75449 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KATNA1O75449 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 247.3 ms