Protein–RNA interactions for Protein: O60841

EIF5B, Eukaryotic translation initiation factor 5B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF5BO60841 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
EIF5BO60841 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EIF5BO60841 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
EIF5BO60841 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms