Protein–RNA interactions for Protein: A6NK06

ACOD1, Cis-aconitate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOD1A6NK06 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACOD1A6NK06 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACOD1A6NK06 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms