Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPOCD1Q6ZMY3 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms