Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDKL1Q00532 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms