Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE4

IARS2, Isoleucine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IARS2Q9NSE4 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IARS2Q9NSE4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IARS2Q9NSE4 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IARS2Q9NSE4 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IARS2Q9NSE4 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IARS2Q9NSE4 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IARS2Q9NSE4 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IARS2Q9NSE4 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IARS2Q9NSE4 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IARS2Q9NSE4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IARS2Q9NSE4 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IARS2Q9NSE4 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IARS2Q9NSE4 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IARS2Q9NSE4 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IARS2Q9NSE4 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms