Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

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Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CNTNAP3Q9BZ76 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CNTNAP3Q9BZ76 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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CNTNAP3Q9BZ76 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CNTNAP3Q9BZ76 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CNTNAP3Q9BZ76 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CNTNAP3Q9BZ76 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CNTNAP3Q9BZ76 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CNTNAP3Q9BZ76 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CNTNAP3Q9BZ76 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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