Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CENPFP49454 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPFP49454 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPFP49454 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPFP49454 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPFP49454 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CENPFP49454 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPFP49454 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPFP49454 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPFP49454 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CENPFP49454 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CENPFP49454 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CENPFP49454 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPFP49454 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPFP49454 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPFP49454 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPFP49454 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPFP49454 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPFP49454 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPFP49454 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPFP49454 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPFP49454 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPFP49454 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPFP49454 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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CENPFP49454 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPFP49454 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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CENPFP49454 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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CENPFP49454 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CENPFP49454 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CENPFP49454 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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CENPFP49454 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPFP49454 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPFP49454 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPFP49454 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPFP49454 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPFP49454 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPFP49454 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPFP49454 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPFP49454 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPFP49454 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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