RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456467.1

SIX3-AS1-202, SIX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SIX3-AS1, Length 557 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3-AS1-202ENST00000456467 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.31■■■□□ 2.92
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ABCC9O60706 1549 aa30.63■■■□□ 2.49
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.87■■■□□ 2.37
SIX3-AS1-202ENST00000456467 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.35■■■□□ 2.29
SIX3-AS1-202ENST00000456467 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.75■■■□□ 2.19
SIX3-AS1-202ENST00000456467 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.61■■■□□ 2.17
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.6■■■□□ 2.17
SIX3-AS1-202ENST00000456467 NACADO15069 1562 aa28.45■■■□□ 2.14
SIX3-AS1-202ENST00000456467 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.11■■■□□ 2.09
SIX3-AS1-202ENST00000456467 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.05■■■□□ 2.08
SIX3-AS1-202ENST00000456467 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.85■■■□□ 2.05
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.57■■■□□ 2
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.54■■■□□ 2
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SCRIBQ14160 1630 aa27.38■■□□□ 1.97
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.37■■□□□ 1.97
SIX3-AS1-202ENST00000456467 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.36■■□□□ 1.97
SIX3-AS1-202ENST00000456467 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
SIX3-AS1-202ENST00000456467 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.15■■□□□ 1.94
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CUX2O14529 1486 aa26.4■■□□□ 1.82
SIX3-AS1-202ENST00000456467 NCAPD3P42695 1498 aa26.37■■□□□ 1.81
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ERCC6Q03468 1493 aa26.37■■□□□ 1.81
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.24■■□□□ 1.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 NESP48681 1621 aa26.21■■□□□ 1.79
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SMARCA2P51531 1590 aa26.02■■□□□ 1.76
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SMARCA4P51532 1647 aa26.02■■□□□ 1.76
SIX3-AS1-202ENST00000456467 HMGXB3Q12766 1538 aa25.99■■□□□ 1.75
SIX3-AS1-202ENST00000456467 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
SIX3-AS1-202ENST00000456467 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
SIX3-AS1-202ENST00000456467 TRIM41Q8WV44 630 aa25.83■■□□□ 1.73
SIX3-AS1-202ENST00000456467 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
SIX3-AS1-202ENST00000456467 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.73■■□□□ 1.71
SIX3-AS1-202ENST00000456467 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.73■■□□□ 1.71
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.72■■□□□ 1.71
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.69■■□□□ 1.7
SIX3-AS1-202ENST00000456467 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.68■■□□□ 1.7
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.59■■□□□ 1.69
SIX3-AS1-202ENST00000456467 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.47■■□□□ 1.67
SIX3-AS1-202ENST00000456467 WDR62O43379 1518 aa25.39■■□□□ 1.66
SIX3-AS1-202ENST00000456467 WIZO95785 1651 aa25.36■■□□□ 1.65
SIX3-AS1-202ENST00000456467 OSCARQ8IYS5 282 aa25.33■■□□□ 1.65
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.27■■□□□ 1.64
SIX3-AS1-202ENST00000456467 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.26■■□□□ 1.63
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CFTRP13569 1480 aa25.15■■□□□ 1.62
SIX3-AS1-202ENST00000456467 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
SIX3-AS1-202ENST00000456467 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
SIX3-AS1-202ENST00000456467 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.91■■□□□ 1.58
SIX3-AS1-202ENST00000456467 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.91■■□□□ 1.58
SIX3-AS1-202ENST00000456467 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.91■■□□□ 1.58
SIX3-AS1-202ENST00000456467 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.85■■□□□ 1.57
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ARHGEF11O15085 1522 aa24.8■■□□□ 1.56
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.79■■□□□ 1.56
SIX3-AS1-202ENST00000456467 IFT140Q96RY7 1462 aa24.79■■□□□ 1.56
SIX3-AS1-202ENST00000456467 TOPBP1Q92547 1522 aa24.72■■□□□ 1.55
SIX3-AS1-202ENST00000456467 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
SIX3-AS1-202ENST00000456467 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.69■■□□□ 1.54
SIX3-AS1-202ENST00000456467 FBLN2P98095 1184 aa24.67■■□□□ 1.54
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PRDM2Q13029 1718 aa24.63■■□□□ 1.53
SIX3-AS1-202ENST00000456467 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ARAP1Q96P48 1450 aa24.56■■□□□ 1.52
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ABCC8Q09428 1581 aa24.54■■□□□ 1.52
SIX3-AS1-202ENST00000456467 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.52■■□□□ 1.52
SIX3-AS1-202ENST00000456467 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CHD1O14646 1710 aa24.51■■□□□ 1.51
SIX3-AS1-202ENST00000456467 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
SIX3-AS1-202ENST00000456467 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.48■■□□□ 1.51
SIX3-AS1-202ENST00000456467 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SOGA1O94964 1423 aa24.41■■□□□ 1.5
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.3■■□□□ 1.48
SIX3-AS1-202ENST00000456467 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
SIX3-AS1-202ENST00000456467 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.24■■□□□ 1.47
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.24■■□□□ 1.47
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CUX1P39880 1505 aa24.16■■□□□ 1.46
SIX3-AS1-202ENST00000456467 GRIN2BQ13224 1484 aa24.14■■□□□ 1.46
SIX3-AS1-202ENST00000456467 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SYNJ1O43426 1573 aa24.13■■□□□ 1.45
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SYNJ2O15056 1496 aa24.11■■□□□ 1.45
SIX3-AS1-202ENST00000456467 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.08■■□□□ 1.45
SIX3-AS1-202ENST00000456467 WDR97A6NE52 1622 aa24.03■■□□□ 1.44
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.97■■□□□ 1.43
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PBRM1Q86U86 1689 aa23.92■■□□□ 1.42
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.89■■□□□ 1.42
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.84■■□□□ 1.41
SIX3-AS1-202ENST00000456467 GRIN2AQ12879 1464 aa23.83■■□□□ 1.41
SIX3-AS1-202ENST00000456467 CEP170Q5SW79 1584 aa23.79■■□□□ 1.4
SIX3-AS1-202ENST00000456467 NUP160Q12769 1436 aa23.78■■□□□ 1.4
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
SIX3-AS1-202ENST00000456467 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.75■■□□□ 1.39
SIX3-AS1-202ENST00000456467 JPH4Q96JJ6 628 aa23.7■■□□□ 1.38
SIX3-AS1-202ENST00000456467 ADAMTS12P58397 1594 aa23.69■■□□□ 1.38
SIX3-AS1-202ENST00000456467 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.69■■□□□ 1.38
SIX3-AS1-202ENST00000456467 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
SIX3-AS1-202ENST00000456467 SHROOM2Q13796 1616 aa23.66■■□□□ 1.38
SIX3-AS1-202ENST00000456467 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.64■■□□□ 1.37
SIX3-AS1-202ENST00000456467 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.61■■□□□ 1.37
SIX3-AS1-202ENST00000456467 TOP2BQ02880 1626 aa23.56■■□□□ 1.36
SIX3-AS1-202ENST00000456467 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.3 ms