Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBA6

C6orf48, Protein G8, humanhuman

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Length 75 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48Q9UBA6 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
C6orf48Q9UBA6 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
C6orf48Q9UBA6 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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