Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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PXDC1Q5TGL8 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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PXDC1Q5TGL8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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PXDC1Q5TGL8 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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PXDC1Q5TGL8 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PXDC1Q5TGL8 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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