Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NHLH2Q02577 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms