Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB4P16144 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms