Protein–RNA interactions for Protein: P35321

SPRR1A, Cornifin-A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1AP35321 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms