Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms