Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
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GTF3C6Q969F1 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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GTF3C6Q969F1 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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GTF3C6Q969F1 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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GTF3C6Q969F1 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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GTF3C6Q969F1 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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GTF3C6Q969F1 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF3C6Q969F1 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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