Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGFRP00533 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGFRP00533 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGFRP00533 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGFRP00533 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGFRP00533 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGFRP00533 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGFRP00533 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGFRP00533 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGFRP00533 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGFRP00533 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGFRP00533 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGFRP00533 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGFRP00533 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGFRP00533 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGFRP00533 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGFRP00533 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGFRP00533 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGFRP00533 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGFRP00533 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGFRP00533 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EGFRP00533 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGFRP00533 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGFRP00533 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGFRP00533 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGFRP00533 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGFRP00533 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGFRP00533 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGFRP00533 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGFRP00533 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGFRP00533 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGFRP00533 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGFRP00533 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EGFRP00533 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGFRP00533 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGFRP00533 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGFRP00533 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGFRP00533 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EGFRP00533 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EGFRP00533 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
EGFRP00533 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGFRP00533 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGFRP00533 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGFRP00533 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGFRP00533 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGFRP00533 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
EGFRP00533 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
EGFRP00533 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EGFRP00533 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
EGFRP00533 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EGFRP00533 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
EGFRP00533 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EGFRP00533 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EGFRP00533 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EGFRP00533 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EGFRP00533 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EGFRP00533 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EGFRP00533 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EGFRP00533 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EGFRP00533 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EGFRP00533 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGFRP00533 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGFRP00533 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGFRP00533 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGFRP00533 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGFRP00533 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGFRP00533 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EGFRP00533 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EGFRP00533 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EGFRP00533 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EGFRP00533 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGFRP00533 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGFRP00533 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGFRP00533 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGFRP00533 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGFRP00533 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGFRP00533 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGFRP00533 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGFRP00533 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGFRP00533 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGFRP00533 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGFRP00533 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGFRP00533 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGFRP00533 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGFRP00533 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGFRP00533 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGFRP00533 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EGFRP00533 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGFRP00533 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGFRP00533 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGFRP00533 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGFRP00533 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGFRP00533 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGFRP00533 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGFRP00533 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EGFRP00533 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EGFRP00533 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGFRP00533 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGFRP00533 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EGFRP00533 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms