Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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SNX13Q9Y5W8 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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SNX13Q9Y5W8 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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SNX13Q9Y5W8 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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SNX13Q9Y5W8 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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SNX13Q9Y5W8 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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SNX13Q9Y5W8 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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SNX13Q9Y5W8 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SNX13Q9Y5W8 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SNX13Q9Y5W8 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SNX13Q9Y5W8 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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