Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TCAF1Q9Y4C2 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TCAF1Q9Y4C2 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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