Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCSK1NQ9UHG2 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCSK1NQ9UHG2 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCSK1NQ9UHG2 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCSK1NQ9UHG2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCSK1NQ9UHG2 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCSK1NQ9UHG2 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCSK1NQ9UHG2 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCSK1NQ9UHG2 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCSK1NQ9UHG2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCSK1NQ9UHG2 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCSK1NQ9UHG2 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCSK1NQ9UHG2 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCSK1NQ9UHG2 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCSK1NQ9UHG2 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCSK1NQ9UHG2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCSK1NQ9UHG2 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PCSK1NQ9UHG2 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCSK1NQ9UHG2 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCSK1NQ9UHG2 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCSK1NQ9UHG2 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCSK1NQ9UHG2 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PCSK1NQ9UHG2 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCSK1NQ9UHG2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCSK1NQ9UHG2 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCSK1NQ9UHG2 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PCSK1NQ9UHG2 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCSK1NQ9UHG2 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCSK1NQ9UHG2 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCSK1NQ9UHG2 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCSK1NQ9UHG2 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCSK1NQ9UHG2 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PCSK1NQ9UHG2 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCSK1NQ9UHG2 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCSK1NQ9UHG2 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCSK1NQ9UHG2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCSK1NQ9UHG2 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms