Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms