Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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SMCO1Q147U7 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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SMCO1Q147U7 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SMCO1Q147U7 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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