Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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KCNB1Q14721 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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KCNB1Q14721 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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KCNB1Q14721 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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KCNB1Q14721 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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KCNB1Q14721 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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KCNB1Q14721 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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KCNB1Q14721 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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KCNB1Q14721 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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KCNB1Q14721 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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KCNB1Q14721 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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KCNB1Q14721 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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KCNB1Q14721 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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KCNB1Q14721 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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KCNB1Q14721 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNB1Q14721 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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