Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSPB3Q12988 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms