Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CREB1P16220 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CREB1P16220 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB1P16220 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB1P16220 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB1P16220 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB1P16220 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB1P16220 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB1P16220 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB1P16220 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB1P16220 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB1P16220 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB1P16220 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB1P16220 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB1P16220 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB1P16220 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB1P16220 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB1P16220 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB1P16220 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB1P16220 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB1P16220 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB1P16220 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB1P16220 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB1P16220 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB1P16220 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB1P16220 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB1P16220 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB1P16220 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB1P16220 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB1P16220 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB1P16220 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB1P16220 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB1P16220 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB1P16220 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB1P16220 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB1P16220 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB1P16220 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB1P16220 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB1P16220 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB1P16220 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB1P16220 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB1P16220 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB1P16220 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB1P16220 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CREB1P16220 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CREB1P16220 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms