Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF3C6Q969F1 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GTF3C6Q969F1 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms