Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCID2Q5JVF3 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCID2Q5JVF3 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms