Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTAN1Q13813 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTAN1Q13813 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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