Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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SCGB2A2Q13296 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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SCGB2A2Q13296 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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SCGB2A2Q13296 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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SCGB2A2Q13296 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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SCGB2A2Q13296 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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SCGB2A2Q13296 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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SCGB2A2Q13296 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SCGB2A2Q13296 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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