Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X3

CCL27, C-C motif chemokine 27, humanhuman

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL27Q9Y4X3 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms