Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIRIP3Q9BW71 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms