Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms