Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SGCAQ16586 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SGCAQ16586 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SGCAQ16586 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SGCAQ16586 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SGCAQ16586 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SGCAQ16586 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SGCAQ16586 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SGCAQ16586 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SGCAQ16586 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SGCAQ16586 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SGCAQ16586 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SGCAQ16586 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SGCAQ16586 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SGCAQ16586 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SGCAQ16586 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SGCAQ16586 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SGCAQ16586 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SGCAQ16586 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SGCAQ16586 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SGCAQ16586 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SGCAQ16586 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SGCAQ16586 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SGCAQ16586 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SGCAQ16586 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SGCAQ16586 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SGCAQ16586 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SGCAQ16586 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SGCAQ16586 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SGCAQ16586 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SGCAQ16586 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SGCAQ16586 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SGCAQ16586 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SGCAQ16586 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SGCAQ16586 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SGCAQ16586 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SGCAQ16586 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGCAQ16586 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGCAQ16586 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SGCAQ16586 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SGCAQ16586 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SGCAQ16586 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SGCAQ16586 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SGCAQ16586 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SGCAQ16586 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SGCAQ16586 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SGCAQ16586 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SGCAQ16586 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SGCAQ16586 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SGCAQ16586 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SGCAQ16586 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SGCAQ16586 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGCAQ16586 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SGCAQ16586 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SGCAQ16586 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGCAQ16586 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGCAQ16586 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGCAQ16586 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SGCAQ16586 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SGCAQ16586 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGCAQ16586 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SGCAQ16586 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SGCAQ16586 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SGCAQ16586 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SGCAQ16586 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SGCAQ16586 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SGCAQ16586 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SGCAQ16586 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SGCAQ16586 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SGCAQ16586 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SGCAQ16586 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SGCAQ16586 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SGCAQ16586 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SGCAQ16586 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SGCAQ16586 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SGCAQ16586 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SGCAQ16586 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SGCAQ16586 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SGCAQ16586 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SGCAQ16586 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SGCAQ16586 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SGCAQ16586 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SGCAQ16586 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SGCAQ16586 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGCAQ16586 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGCAQ16586 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGCAQ16586 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGCAQ16586 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGCAQ16586 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SGCAQ16586 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGCAQ16586 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGCAQ16586 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGCAQ16586 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SGCAQ16586 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGCAQ16586 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGCAQ16586 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGCAQ16586 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGCAQ16586 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGCAQ16586 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SGCAQ16586 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms