Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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