Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NCOA4Q13772 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms