Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NHLH2Q02577 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NHLH2Q02577 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms