Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRB3P28472 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms