Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGB6P18564 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms