Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCATO75600 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCATO75600 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCATO75600 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCATO75600 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCATO75600 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCATO75600 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCATO75600 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCATO75600 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCATO75600 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCATO75600 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCATO75600 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCATO75600 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCATO75600 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCATO75600 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCATO75600 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCATO75600 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCATO75600 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCATO75600 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GCATO75600 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCATO75600 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCATO75600 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCATO75600 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCATO75600 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCATO75600 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCATO75600 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCATO75600 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCATO75600 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms