Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PALM2-AKAP2B1ALY0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PALM2-AKAP2B1ALY0 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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