Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAT1Q99536 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms