Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms