Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP1P29466 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP1P29466 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP1P29466 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP1P29466 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP1P29466 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP1P29466 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP1P29466 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP1P29466 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP1P29466 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP1P29466 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP1P29466 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP1P29466 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP1P29466 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP1P29466 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP1P29466 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP1P29466 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP1P29466 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP1P29466 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP1P29466 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP1P29466 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP1P29466 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP1P29466 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP1P29466 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP1P29466 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP1P29466 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP1P29466 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP1P29466 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP1P29466 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP1P29466 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP1P29466 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP1P29466 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP1P29466 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP1P29466 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP1P29466 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP1P29466 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP1P29466 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP1P29466 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP1P29466 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP1P29466 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP1P29466 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP1P29466 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP1P29466 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP1P29466 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP1P29466 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP1P29466 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP1P29466 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP1P29466 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP1P29466 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP1P29466 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CASP1P29466 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms