Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNB1P01574 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms