Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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CTDSP2O14595 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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CTDSP2O14595 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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CTDSP2O14595 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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CTDSP2O14595 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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