Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN9

TRIM33, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM33Q9UPN9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM33Q9UPN9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM33Q9UPN9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms