Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM2

ZNF490, Zinc finger protein 490, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF490Q9ULM2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF490Q9ULM2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF490Q9ULM2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms