Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNOT8Q9UFF9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CNOT8Q9UFF9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNOT8Q9UFF9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNOT8Q9UFF9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNOT8Q9UFF9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNOT8Q9UFF9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNOT8Q9UFF9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNOT8Q9UFF9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNOT8Q9UFF9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNOT8Q9UFF9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNOT8Q9UFF9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNOT8Q9UFF9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNOT8Q9UFF9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNOT8Q9UFF9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNOT8Q9UFF9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNOT8Q9UFF9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNOT8Q9UFF9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNOT8Q9UFF9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNOT8Q9UFF9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNOT8Q9UFF9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CNOT8Q9UFF9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNOT8Q9UFF9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNOT8Q9UFF9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNOT8Q9UFF9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNOT8Q9UFF9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNOT8Q9UFF9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNOT8Q9UFF9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNOT8Q9UFF9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNOT8Q9UFF9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNOT8Q9UFF9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CNOT8Q9UFF9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CNOT8Q9UFF9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNOT8Q9UFF9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNOT8Q9UFF9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNOT8Q9UFF9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNOT8Q9UFF9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNOT8Q9UFF9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNOT8Q9UFF9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CNOT8Q9UFF9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNOT8Q9UFF9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNOT8Q9UFF9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNOT8Q9UFF9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNOT8Q9UFF9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNOT8Q9UFF9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms