Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLHL13Q9P2N7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL13Q9P2N7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL13Q9P2N7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms